Les BU (Business Unit ou unités d’affaires) sont les entités de l’EPIC qui pilotent les activités opérationnelles (exploitation, maintenance, gestion d’infrastructures et sureté essentiellement) réalisées par l’Epic RATP dans le cadre du contrat conclu avec IDFM, et régulées pour certaines par l’Autorité de Régulation des Transports (GI, sûreté). Les BU sont ainsi en charge des activités en monopole.

Les filiales sont des sociétés détenues ou contrôlées par l’EPIC RATP qui pilotent les activités opérationnelles du groupe RATP dans le domaine concurrentiel, en Ile-de-France, en régions ou ailleurs dans le monde. En général, dans le domaine du transport public, une nouvelle filiale doit être créée en réponse à chaque appel d’offres, correspondant au périmètre du réseau de transport et du contrat conclu avec l’Autorité organisatrice. Les filiales sont des entités juridiquement distinctes.